随着基因测序技术的快速发展,全球基因组的数据正在呈指数级增长,对于如此大规模的基因数据的同源性搜寻、比对、分析和遗传发育分析等,往往伴随着巨量的数据处理和并行计算,需要借助高性能计算平台来完成相应工作。除此之外,在蛋白质和DNA的研究中,还包括三维结构预测、分子动力学分析、分子对接(药物设计)等,这些科学问题也需要借助于高性能计算集群。
针对生命科学领域高性能计算的需求,浪潮信息依托自身在高性能计算领域以及生命科学行业的丰富经验,推出了具有高性能、可扩展、简管理、易使用等特性的生命科学高性能计算解决方案,该方案有机融合了浪潮信息的软硬件产品及综合服务能力,可以为基因测序、蛋白质分析等生命科学领域的科研探索和临床研究提供强有力的支撑。
方案包括硬件平台和软件平台两部分:
硬件平台:浪潮信息提供丰富的服务器产品,包括两路/四路/八路计算节点以及GPU节点等,基于最新一代x86处理器和GPU加速卡能够提供极致的计算性能;同时,浪潮信息的并行文件存储兼具高性能和高可靠性,能够满足大量数据存放及高速访问的需求。
软件平台:浪潮信息集群管理调度平台可以实现大规模集群的管理和作业调度,有效提高集群资源的利用率和作业执行效率;同时, ISPIM能够简化物理基础设施管理,Teye能够分析应用运行特征并辅助应用调优。
基于浪潮信息的软硬件平台构建的高性能计算集群,可以支撑基因组学、蛋白质结构、药物设计、冷冻电镜等生命科学领域的业务应用。
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